水源染是“两虫”疾病大的源，后的救治成本远高于提前预防成本，已成为各国需要防控的公共卫生疾病。我国于2006年颁布的《生活饮用水卫生标准》在微生物学指标中增加了“两虫”的检验，对饮用水“两虫”指标进行监测的重要性可见一斑。“两虫”严重威胁着人们的饮用水，水质监测单位面临着严格的考验。
水体中“两虫”的检测方法多为磁分离法和荧光法。磁分离操作过程繁锁、要求手工操作且操作者需十分细心，仪器使用成本高、维护困难，检测难度较大，一定程度上限制了该检测法的实用性及普及性。荧光法借助的荧光显微镜来区分杂质和两虫。
两虫检测系统的先进性、准确性、兼容性、经济性 1. 标记单：包括抗隐孢子虫和抗贾第鞭毛虫单的异硫酸荧光素（FITC），系一种球蛋白M五聚体，由5个FITC结合点位同时标记一个，具有显著的明亮荧光效果，该是推荐的染色试剂。2. 提供固色液：固色液使显色更稳定，几天后仍镜检效果依然清晰。3.提供阳性对照玻片：试剂盒（5次测试量）中含一个预制的载玻片供随时反复多次使用，使测试更便捷更省时，且经济实用。
水质检测结果准确性、稳定性相关对策的研究，必须认识到水质检测的重要性。水质检测工作要求极为严格，因为检测工作包含多方面，需要检测工业废水、生活废水、无污染水源等，对比水质检测中的污染物，及时划分种类。水质检测中有毒物质的检测中，包含工业原料等物质，这些都是有毒物质检测类别的重要检测对象。水质检测根据试验检测获得水资源中不同物质的含量，对相关数值详细统计，及时与标准水质数据加以对此，从而得到检测水质情况。