档案的实体案卷或文件的完整性需要检查和加固性处理
当案卷或文件有规格不一、纸张破损、卷边折边等情况，就需要启动实体修整工作，以确保档案实体平整清洁，适于数字化。修整性工作包括美观性整理与加固性整理。美观性整理主要是指档案材料的清洁，包括清扫灰尘，去除残留装订物，舒展折边卷边等。其目的是使纸质档案实体高质量进入扫描设备。加固性整理，一般指对非标准规格档案、破损档案、过脆档案进行衬页、托裱等，进一步保护和延长实体寿命。
档案整理的两大要素
①系统排列和编目
在正常条件下，档案室接收文书部门和业务部门按照归档要求立好的案卷，档案馆接收各机关按照入馆要求整理移交的案卷。档案馆和档案室的整理任务，主要是检查案卷质量，制订馆(室)内分类排列方案，进行案卷和全宗的系统排列以及案卷目录的加工
②局部调整
对已接收但不完全符合整理要求的案卷，进行必要的部分加工整理；对由于遭受损失、销毁与移出等各种原因致使整理体系发生重大变化的档案,进行新的系统化调整
会计档案的整理原则和标准
会计档案:是指会计凭证、会计账薄和财务会计报告等会计核算材料，是记录和反映本单位经济业务的重要史料和证据
整理原则：会计档案整理归档时必须收集齐全完整(包括纸质及磁带、光盘等磁性介质材料)，做到不隔年、不漏月、不短件。
在整理会计档案时，使用的装具应做到整齐统一，类目醒目。记账凭证使用标准卷皮的不可装盒(袋);会计账薄财务会计报告以及其他材料必须装会计档案盒保管。会计档案卷皮、卷盒背脊要注明年月、类别、期限和卷号。
档案整理工作方案的制定
为了使积存零散档案文件的整理工作能够顺利地进行，在整理以前，应先了解档案的情况，订出一个整理工作方案。此工作方案包括以下内容:立档单位的历史沿革和档案状况，整理的要求和具体方法，工作程序劳动组织，以及各工作完成时间。根据所要整理的档案状况、数量以及参加整理人数的不同，来针对性制定方案，整理工作方案可详可简。整理工作方案一般以全宗为单位编订。整理互有联系或同类型若干全宗时，也可以合编一个整理工作方案。