档案文件在整理过程中要注意维护和保持原有的基础
档案文件是在特定的历史、条件、环境、事件背景下形成的，在整理过程中一定要维护和保持，以便未来再现这种历史联系。档案的整理应该充分利用原有的基础，充分重视和利用先前整理的基础，不要轻易的打乱、重整。
例如业务部门或者文书人员整理的顺序、整理的方法，如果仅因为个人感觉已经落伍，就把它重新打乱、重新按照自已的要求来做，像这种观念是不可取的，我们提倡应该充分的重视和利用之前已经整理好的那种已有的这个基础。
档案整理的两大要素
①系统排列和编目
在正常条件下，档案室接收文书部门和业务部门按照归档要求立好的案卷，档案馆接收各机关按照入馆要求整理移交的案卷。档案馆和档案室的整理任务，主要是检查案卷质量，制订馆(室)内分类排列方案，进行案卷和全宗的系统排列以及案卷目录的加工
②局部调整
对已接收但不完全符合整理要求的案卷，进行必要的部分加工整理；对由于遭受损失、销毁与移出等各种原因致使整理体系发生重大变化的档案,进行新的系统化调整
档案整理方法
首先需要确保产品、项目型号等全部档案资料的性和真实性，在整理时，将相关档案资料进行集中相邻排列，确保相关档案信息能够形成整体性。在运用案卷级整理方法时，需要对档案信息著录的深入度加强重视，确保后期档案信息查找的效率和准确性，在实际整理过程中，可对案卷概念予以保留，对整卷装订的方式进行改进，将卷内文件分别进行独立装订，再根据卷内文件序号进行档案文件的编号和排列。通过这种整理方法，能够使档案案卷的文件级信息著录得以实现，能够更好地满足档案信息查找利用的需求，同时使同一型号、同一产品、同一项目的档案整体性得以有效保证。