如果船舶在营运过程中安排人工清洗油舱，船长应首先考虑到人员进入密闭舱室的安全问题。提前预订添加剂，并确保计划执行燃油舱清洁的轮机长和轮机员知道如何正确使用添加剂。与租家及时沟通，为聘请工程队清洗合理安排好船期。进入程序必须遵守国际海事组织第A.1050(27)号决议关于《进入船上密闭舱室的建议案》中的安全措施。
清洗方法所用时间是基于航运实践的经验总结，并不一定适用于每一船舶。IMO也表示，船舶为满足0.50%m/m含硫量上限而备舱所需的时间和工作量难以预估。船舶进入船坞进行燃油舱清洗所需要的时间因船而异，但一般来说每个燃油舱清洗的平均耗时为2-4天，再加之对船舶燃油系统管路的冲洗。建议会员船东还应尽早安排船舶油舱清洁的各项工作，以满足即将到来的2020全球限硫新标准。
一些航运公司在更换使用燃油舱之前会使用化学添加剂进行清洗。实践证明，这是减少清洗油舱非常有效和经济的方式之一。每艘船彻底完成清洗和冲洗需要的时间大约为1-2周。经过上述彻底清洗和冲洗的油舱和管路，在接收合规的燃油后，基本可以满足公约的排放要求。船舶产生的废水主要包括压舱水、洗舱水、舱底水等。其中洗舱水是船舶产生的废水之一，是指船舶上用来清洗油舱。