次氯酸水消毒剂的优点在于保存时间久、成本低廉，其缺点是易分解出;.产生革兰氏阴性菌之抗药性;排放水对环境造成污染。 市售的漂白水除了次氯酸主成分外，尚添加清洁剂、螯合剂及芳香剂等成分，其比例及种类为厂商自行调配。 且非食品等级漂白水，多采用工业级原料，成分复杂，冲洗后可能有三分之一残留于物品表面。高温下易产生、煮沸时会产生，这些都是对身体有害物质，应尽量远离。
次氯酸水消毒剂是解决次氯酸容易降解的办法，以密闭阻光的容器，经常六个月的时间其总自由氯含量才降解一半，重要的是消毒的使用浓度与其他酸性次氯酸溶液高出不多。 这是因为我们将容易被降解的次氯酸藏起来，让他不会立即产生氧化还原反应，当有病菌消耗掉次氯酸时，我们再将次氯酸根转换为次氯酸，如此循环可同时保有良好消毒效果及保存效果。
次氯酸水消毒剂与这些消毒剂对比如何。当然，要做对比，我们就须限定在一定的条件下：
(1)本次对比只对照民用消毒产品，消毒产品等多用消毒剂不在本次对比的范围;
(2)只对比化学消毒剂，物理消毒产品，如紫外灯，不在本次对比的范围内;
(3)只对比物质性能，不对比具体产品，因为不同浓度或配方的制剂及不同企业生产的产品稳定性有差别;
(4)对比项目主要选定为：安全性、有效性和产品使用等7个方面。