牲畜废水处理的方法：自然处理法
自然处理法是牲畜废水处理技术比较传统的方法。自然处理法是利用天然水体、土壤和生物的物理、 化学与生物的综合作用来净化污水。其净化机理主要包括过滤、 截留、 沉淀、 物理和化学吸附、化学分解、生物氧化以及生物的吸收等。其原理涉及生态系统中物种共生、 物质循环再生原理、结构与功能协调原则, 分层多级截留、储藏、利用和转化营养物质机制等。这类方法投资省、工艺简单、动力消耗少，但净化功能受自然条件的制约。自然处理的主要模式有氧化塘、土壤处理法、人工湿地处理法等。
牲畜废水处理的方法：厌氧处理技术好氧处理技术
好氧处理的基本原理是利用微生物在好氧条件下分解有机物，同时合成自身细胞(活性污泥)。在好氧处理中，可生物降解的有机物可被完全氧化为简单的无机物。该方法主要有活性污泥法和生物滤池、生物转盘、生物接触氧化、序批式活性污泥、A/O及氧化沟等。采用好氧技术对畜禽废水进行生物处理，这方面研究的较多的是水解与 SBR 结合的工艺。SBR ( sequencing batch reactor) 工艺，即序批式活性污泥法，是基于传统的Fill- Draw 系统改进并发展起来的一种间歇式活性污泥工艺，它把污水处理构筑物从空间系列转化为时间系列， 在同一构筑物内进行进水、反应、沉淀、排水、闲置等周期循环。SBR 与水解方式结合处理畜禽废水时，水解过程对COD Cr有较高的去除率，SBR 对总磷去除率为 74.1% ，高浓度氨氮去除率达 97%以上。此外，其他好氧处理技术也逐渐应用于畜禽废水处理中，如间歇式排水延迟曝气( IDEA )、循环式活性污泥系统( CASS )、间歇式循环延迟曝气活性污泥法( ICEAS )。
分离处理
污染物在废中的存在状态，可分为离子分散态、分子分散态、胶体分散态和悬浮物分散态四类。在任一状态的分散粒子上都作用有许多外力，但由于离子的颗粒大小、粒度分布不同，物理和化学特性各异，所以各种外力对它们产生的总效应也不一样。例如，对悬浮物而言，重力和离心力的作用十分明显，而分子力就微不足道。对分子或离子物质起作用的主要是化学键力，而重力和离心力就不起作用。由此可见，四类污染物的分离方法各不相同。